La brillante inauguración del Instituto Pasteur tuvo lugar el 14 de noviembre de 1888, con la presencia del presidente francés Sidi Carnot y la del propio Pasteur. La financiación se realizó mediante suscripción popular que incluyó aportaciones individuales desde un décimo de franco a un millón de francos. Desde el principio Pasteur quiso algo original en aquel entonces, que el Instituto fuese no solo un dispensario de tratamiento y vacunación contra la rabia, sino también un centro prestigioso de colaboración internacional de enseñanza e Investigación sobre enfermedades infecciosas. Ello históricamente se ha cumplido con creces. En 1990 se le adosó un gran hospital de Investigación, posee un gran campus de edificios especializados y actualmente ocupa un puesto importante en la lucha contra el SIDA. Fue en el Instituto Pasteur donde en 1984 se identificó por primera vez el virus responsable del SIDA. El Instituto Pasteur cuenta con delegaciones en diversos países mediterráneos y de influencia francesa.